Visualizzazione di network di interazione tra proteine (sulla base di parole chiave)

  • pigolio

Sentinel (progetto pazzesco!!!)

Sentinel No comment! Ho l’invidia per gente TANTO creativa!!

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Si cercano bioinformatici!! (oppotunità al DIBIT)

Ultimamente mi girano sotto gli occhi tante opportunità di lavoro, ma per lo più sono per posizioni high level. Questa mi pare particolarmente appetibile, essendo -per pigri – qui in Italia, presso il dibit. Naturalmente ve la lascio in inglese, e vi segnalo solo il telefono, non la mail per evitare eventuali spider collettori spam. … Continua a leggere →

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Presentazione per Galaxy (nuova piattaforma per analizzare dati genomici)

L’integrazione è sempre più facile da realizzare. Ecco uploadata una presentazione powerpoint di questo nuovo tool, di cui parlo su Inside Bioinfo. Un click ed ecco per i più pigri una favolosa presentazione offerta dal bioamico Matteo Cesaroni! Many thanks!!

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applicazioni biologiche per alberi dei suffissi

Le sequenze di informazioni biologiche sono comunemente archiviate in locazioni contigue della memoria del computer. Questo metodo di stoccaggio non risulta efficiente per un certo numero di applicazioni. Il nodo del problema sta nel fatto che i dati archiviati in modo sequenziale devono in buona sostanza essere processate in modo sequenziale. Invece, spesso, il valore … Continua a leggere →

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altra interessante opportunità

The UNIBASEL-DKBV (Departement Klinisch-Biologische Wissenschaften Universitat Basel)                          are looking to recruit A RESEARCH TECHNICIAN IN MOLECULAR BIOLOGY (100% – permanent; starting November 1, 2007 or as agreed) The successful applicant must have been trained as a research technician or hold an equivalent degree (but not a PhD). She/he will be highly motivated and ideally have … Continua a leggere →

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job opportunity: occasione per un bioinformatico in UK

Velocemente vi copio/incollo una nuova possibilità per fare un po’ di buona scienza in Scozia. Un’esperienza all’estero come fa a non attirare???:-) Opening for a computer scientist to help solving one of the fundamental problems of Cell Biology: the elucidation of protein-protein interactions   Reference     Job Type Full-time   Job Status Sourcing   … Continua a leggere →

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Visualizzazione di network di interazione tra proteine (sulla base di parole chiave)

Parlando di protein-protein interaction, risulta spesso difficoltoso creare classi e categorie per poter assemblare cluster funzionali di proteine. Le informazioni circa interazioni funzionali sono o non disponibili, o limitate a piccoli e ben specifici gruppi proteici, oppure sono sottoposte a una diaspora che costringe il bioinformatico a raccogliere i dati dalle fonti e database più … Continua a leggere →

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un bash file per gestire agevolmente procedure e viste mysql

se sei un bioinformatico bravo e buono ti avran chiesto gentilmente almeno una volta di gestire il DB opensource (mysql, naturalmente) del tuo laboratorio; e questo col tempo diventerà sempre più complesso, con una proliferazione di query, stored procedure e viste. Il tutto in un organizzato disordine. Personalmente trovo utile cercare di tenere quanto più … Continua a leggere →

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bio::blog #14 è uscito

Come al solito anche questo numero di bio::blog è pregno di interessanti link. Navigateli! Mi lascia sorridente un articolo di Sandra Porter , linkato alla fine, che discute di quanto sia importante anche per un biologo imparare a programmare. A dimostrazione che le idee navigano da una regione all’altra, da una mente all’altra (sarà telepatia) … Continua a leggere →

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una chicca per un minuto di spasso (gli ingegneri sono umani molto strani)

Ho uploadato nel box dei file qui di fianco un nuovo file mp3 che mi è giunto. Ahh, i bei tempi dei corsi di ingegneria! Questo breve spezzone è un sunto filosofico che a nessuno dovrebbe essere negato; è una chiara espressione delle motivazioni per cui alcuni di noi si fanno del male iscrivendosi a … Continua a leggere →

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  • Fonti di informazioni